Этот природный заповедник был основан в 1979 году как подразделение биостанции. Заповедник простирается более чем на 20 км на суше и около 10км водной глади. Своим названием он обязан самой высокой из вершин горной группы горе Святая, высотой 577метров. Ранее её называла Кадагар (Черная гора), позднее так стали именовать всю горную группу, расположенную в окрестностях Коктебеля. Кадагар – это ещё и древнейший вулкан, который действовал около 150 млн. лет назад, оставивший после себя богатое наследство полудрагоценных камней и ценных минералов опал, агат, сердолик, халцедон и других.
Заповедник – это интереснейшее место с первозданной и уникальной флорой и фауной, сохранившее свою первозданность на протяжении миллионов лет. Целью его создания было желание сохранить это природное творение и останки древнего вулкана, которые скрывают в себе множество информации и загадок, потому что в конце 70-х множество народу, как туристических групп, так и желающие отдохнуть дикарями, посещало эти места. И от подобных посещений животный, растительный и минерально-каменный миры пострадали настолько, что появились опасения, что вскоре живописные места Кара-Даг превратятся в пустыню.
Благодаря своевременному вмешательству многие виды животного и растительного мира смогли восстановиться. Множество растений и животных, обитающих в Карадагском заповеднике, занесены в Красную книгу и не встречаются больше ни в одном месте на Земле.
Так же здесь нашли пристанище косули, лисицы, куницы, ежи, кабаны и многие другие животные.
На территории Карадагского заповедника расположены и три хребта горной гряды, неоднородные по происхождению и возрасту, наиболее интересен из которых – это Береговой хребет. Он является фрагментом вулканического массива, и его большая часть скрывается под водой. Южная часть хребта тянется извилистой береговой линией на протяжении восьми километров и резко обрывается в Черное море. Множество живописных бухт Разбойничья, Львиная, Голубая, Барахта, и гротов Шайтана и Ревущий расположены на этом берегу, привлекая внимание своей первобытной красотой.
Украшением пейзажа являются и причудливые скалы со сказочными названиями: Иван разбойник, Золотые ворота, Слон, Сторожевая и многие другие.
А там, где ранее был огнедышащий вулкан, и потоки раскаленной лавы убивали все живое, сейчас стоят столбы, пики и башни необычных форм и простираются лесные заросли, состоящие из граба, ясеня и сосны.